AlphaFold3 protein_dataset模块 ProteinDataset 类 _process 方法的主要功能是处理单个蛋白质流文件，并将其转换为 ProteinMPNN 所需的特征，最终保存为 pickle 文件。 源代码： def _process(self,filename,rewrite=False,max_length=None,min_cdr_length=None,classes_to_…

当我们使用AF3或其他结构预测工具获得蛋白复合物后，逃不掉的一步就是分析接触界面的残基互作，而分析互作的前提是要准确地识别出接触界面上的残基有哪些，如果手动找则太耗费精力而且也容易遗漏。本期向大家安利的这样一款pymol插件&#xff0…

第一章：文件操作基础与核心原理 1.1 文件系统基础 文件系统是操作系统用于管理存储设备中数据的核心机制。Python通过内置的open()函数实现文件操作，支持文本文件（.txt、.csv）和二进制文件（.jpg、.dat）的…

继首张EP先行曲《MORE AND MORE》近日发行后，由许魏洲组建并担任主唱的PROME乐队首张EP《普罗米修斯》也已正式上线！PROME乐队的乐队名称灵感来源于普罗米修斯，“PROME”也象征“超越自我”的含义，由主唱许魏洲、贝斯手易鑫、吉他…

Vivado 结合Modelsim 实现综合后仿真的一种方法 Post-Synthesis Timing Simulation 使用Vivado 生成仿真所需文件创建Modelsim工程参考文档 使用Vivado 生成仿真所需文件 Vivado simulation 中可勾选Generate simulation scripts only;勾选-sdf_anno; 在testbanch文件中例化gl…

新建工程步骤 建立工程文件夹，Keil中新建工程，选择型号工程文件夹里建立Start,Library,User等文件夹，复制固件库里面的文件到工程文件夹工程里对应建立Start，Library，User等同名称的分组，然后将文件夹内的…

空间转录数据是现代生物学研究的重要基础。然而，技术限制造成的噪声严重干扰了下游的分析。尽管最近在去噪方法方面取得的进展显示出一定的前景，但这些方法依然存在不足，甚至依赖额外的组织学图像作为补充信息。因此，清华大学联合…

电脑如果突然断网是怎么回事 电脑突然断网可能由多种原因造成，以下是常见的因素： 网络连接与权限问题 路由器或调制解调器故障：路由器或调制解调器可能出现硬件故障、软件故障或设置错误。可以尝试重启设备，如果问题依旧&#…