课题组超算上的module模块-只为方便自己查看

发布时间：2026/10/14 20:09:05

课题组超算上的module模块-只为方便自己查看
一、module命令module purge module load XXX module unload XXX二、机群上的模块华东四区山东#华东四区山东------------------------- /work/home/ln2026/apprepo/modules -------------------------- lammps-22Jul2025-oneapi2024.0.1 --------------------------- /public/software/modules/apps ---------------------------- abinit/8.10.3-hpcx-intel-2017 alphafold2/dtk22.04-DCU amber/2018-hpcx-gcc-7.3.1 AutoDock/4.2.6-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 bigDFT/1.8.3-hpcx-intel-2017 Calculix/2.16-hpcx-gcc-7.3.1 castep/22.11/ifort-mpi/linux_x86_64_ifort--mpi cdo/1.7.2-intel-2017 CMAQ/5.3-hpcx-intel-2017 Code_Aster/13.8-hpcx-gcc-7.3.1 COMSA/2.5.1-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 cp2k/2023.1-intelmpi-2018 cp2k/2023.1-intelmpi-2018-plumed cp2k/2023.1-intelmpi-2021 cp2k/2023.2-gcc-930 cp2k/2023.2-intelmpi-2021-plumed cp2k/2024.1-gcc-930 cp2k/4.1-intelmpi-2017 cp2k/5.1-intelmpi-2017 cp2k/6.1.0-hpcx-intel-2017 cp2k/6.1.0-intelmpi-2017-plumed cp2k/7.1-intelmpi-2018 cp2k/7.1-intelmpi-2020 cp2k/8.1-intelmpi-2020 cp2k/8.2-intelmpi-2020 cp2k/9.1-gcc-930 cp2k/9.1-intelmpi-2018 cp2k/9.1-intelmpi-2020 cp2k/9.1-intelmpi-2021 curl/7.58.0-intel-2017 dl-poly/5.1.0-intelmpi-intel-2021 DUNE/2.8-hpcx-gcc-7.3.1 Elmer/8.4-hpcx-intel-2017 FlameGraph/master fvcom/3.2-hpcx-intel-2017 gamess-us/2019R2-hpcx-intel-2017 Genomeworks/0.4.0-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 git/2.30.2-gcc-7.3.1 g_mmpbsa/1.6-gcc-7.3.1 gnuplot/5.0.5-gcc-7.3.1 grads/2.2.0-prebuild grads/2.2.1-gcc-4.8.5 gromacs/2016.6-intelmpi-2021 gromacs/2018.8-intelmpi-2021 gromacs/2019.5-hpcx-intel-2017 gromacs/2019.6-intelmpi-2021 gromacs/2020.1-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 gromacs/2020.3-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 gromacs/2020.6-intelmpi-2021 gromacs/2021.3-intelmpi-2021 gromacs/2021.6-intelmpi-2021 gromacs/2022.1-DCU2-gcc-7.3.1 gromacs/2022.1-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 gromacs/2022.1-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1-bak gromacs/2022.2-hpcx-gcc-7.3.1 gromacs/2023.1-gcc930-intelmpi21 gromacs/4.5.6-intelmpi-2017 gromacs/4.6.7-intelmpi-2021 gromacs/5.0.7-intelmpi-2021 gromacs/5.1.5-intelmpi-2021 gromacs-plumed/2019.6-intelmpi-2021 gromacs-plumed/2020.6-intelmpi-2021 gromacs-plumed/2021.4-intelmpi-2021 Hashcat/6.1.1-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 Hoomd-blue/3.0.0-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 ImageMagick/7.0.10-prebuild IPM/2.0.6-hpcx-gcc-7.3.1 IPM/2.0.6-impi-2017 jdk/19.0.2 lammps/16Mar18-intelmpi-2017 lammps/22Aug18-intelmpi-2017 lammps/23Jun2022-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 lammps/23Jun2022-intel_21 lammps/24Dec2020-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 lammps/24Dec20-intelmpi-2017 lammps/28Mar2023-intel_21 lammps/29Oct20_intel17 lammps/30Jul21-intelmpi-2017 lammps/30Jul21-intelmpi-2021 lammps/3Mar20-intelmpi-2017 lammps/5Jun19-intelmpi-2017 lammps/7Aug19-hpcx-intel-2017 lammps/7Aug19-intelmpi-2017 lammps/8Apr21-intelmpi-2017 MiniFE/2.1.0-hpcx-intel-2017 MISA-AKMC/v0.1.0-beta-hpcx-gcc-7.3.1 MISA-MD/v0.4.0-hpcx-gcc-7.3.1 MISA-SCD/v1.0.0-hpcx-gcc-7.3.1 NAMD/2.13-hpcx-intel-2017 NAMD/2.15-DCU2-gcc-7.3.1 NAMD/2.15-DCU2-hpcx-gcc-7.3.1 ncl_ncarg/6.5.0-gcc-4.8.5 nco/4.6.7-intel-2017 nco/4.6.7-intel-2021 ncview/2.1.7-intel-2017 nwchem/6.8.1-hpcx-intel-2017 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qe/6.6-hpcx-intel-2017 qe/6.6-intelmpi-2017 qe/6.7-intelmpi-2017 qe/6.8-hpcx-intel-2017 qe/6.8-intelmpi-2017 qmcpack/3.9.1-hpcx-gcc-7.3.1 ROMS/3.6-hpcx-intel-2017 siesta/4.0.2-hpcx-intel-2017 SU2/7.0.1-hpcx-gcc-7.3.1 Tensorflow/1.15.1-cp36 tmux/1.8 tmux/3.2 unidock/dtk23.10-DCU vaspkit/1.2.4-prebuild vtstscripts/1033 WPS/3.9.1-hpcx-intel-2017 WRF/3.8-hpcx-intel-2017 WRF/3.9.1-hpcx-intel-2017 WRF/4.2-hpcx-intel-2017 --------------------------- /public/software/modules/base ---------------------------- anaconda2/4.3.0 mathlib/jasper/1.900.1-intel-2017 anaconda3/2023.09 mathlib/jasper/1.900.1-intel-2021 anaconda3/5.2.0 mathlib/lapack/3.8.0-gcc-7.3.1 apps/apptainer/1.2.4 mathlib/lapack/3.8.0-intel-2017 apps/apptainer/1.3.4 mathlib/libjpeg/9.1.0-intel-2017 apptainer/1.2.4 mathlib/libjpeg/9.1.0-intel-2021 automake/1.16.1 mathlib/libpng/1.2.50-gcc-7.3.1 compiler/cmake/3.15.6 mathlib/libpng/1.2.50-intel-2017 compiler/cmake/3.20.4 mathlib/libpng/1.2.50-intel-2021 compiler/cmake/3.23.3 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create-n nequip python3.11-y conda activate nequip module load gcc $ git clone--depth1https://github.com/mir-group/nequip.git $ tar-zxvf nequip-0.19.0.tar.gz $ cd nequip-0.19.0/$ pip install.pip install . 在这里做了这几件事读取构建配置找到目录里的 pyproject.tomlNequIP 用它来声明依赖、构建方式等。解析依赖根据配置文件检查并安装 NequIP 所需的依赖如 torch、e3nn、ase、hydra-core 等。构建项目如果项目包含需要编译的 C/C/CUDA 扩展NequIP 有少量性能相关的 C 扩展会用你当前环境的编译器你之前设置的 GCC 11.4.0进行编译。安装到环境把构建好的包复制到当前 Python 环境的 site-packages 目录即你之前看到的 /work/home/ln2026/miniconda3/envs/nequip/lib/python3.11/site-packages/并生成可执行脚本如 nequip-train、nequip-evaluate 等命令行工具。总结经验缺少补啥配置环境变量配好之后测试一下通过算例。写个脚本。因为网络问题推荐使用源码安装。

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