全新可重分析!代谢组质谱专用
摘要代谢组学研究覆盖极为广阔的化学空间产生大量实验数据在化学、生物学及相关领域具备极高复用潜力。本文开发全新代谢组学质谱数据库MB‑POST设计理念区别于现有平台旨在充分释放上述数据价值。MB‑POST实现面向重分析的元数据框架采集数据复用必需的关键信息同时提供流程简化的数据提交系统支持标准化代谢组学元数据与实验数据快速上传。该平台自2024年12月公开试点上线后获得领域广泛使用上线年半时间内已存入170余个实验项目。因此MB‑POST为代谢组学质谱数据的大规模复用奠定实践基础是推动开放、数据驱动科学研究的项实质性进展。https://repository.massbank.jpfmatsudaist.osaka‑u.ac.jpokdmed.niigata‑u.ac.jp#MBPOST #代谢组学 #质谱 #数据重分析 #元数据 #公共数据库 #FAIR原则 #MassBankMB‑POST整体概念示意代谢组学研究者提交附带高质量元数据的质谱数据集MB‑POST定义的元数据满足重分析需求同时保证输出数据可兼容MassBank存入的数据支持后续重分析与复用面向广大化学领域研究者开放依托积累数据集开展重分析进一步推动数据驱动的化学科学发展。方法元数据管理图1 MB‑POST中「样本」预设模板输入界面截图增量检索功能允许用户在预定义选项之外选择受控术语右侧面板展示关键元数据字段的上下文说明与填写示例。图2 在项目内为文件分配预设配置文件的界面截图用户通过顶部标签页选择待上传文件类型原始数据、峰表、鉴定结果、生物学重复、其他。针对原始数据文件先从下方列表选择需要的预设组合再将目标文件拖拽至页面虚线框区域即可一次性为多个文件分配同一套预设配置。页面底部表格展示本项目全部文件列表同时显示每个文件已经绑定的预设名称。图3 MB‑POST元数据分配概念示意用户创建单个「项目」用于存放提交数据集1个项目可包含多类文件原始数据、峰表数据、鉴定结果、重复样本数据。每个原始数据文件均分配来自4大元数据分类样本、前处理、分析条件、软件设置的预设组合。结果与讨论图4 从预设与项目注册到数据公开发布的完整工作流撰写/修订稿件阶段或为已发表论文注册数据创建预设、填写元数据创建项目选择、修改项目内待录入文件将预设关联至原始数据上传文件完成提交。提交后项目在发布日期之前保持私有状态。 同行评审阶段生成仅审稿人可访问的预览链接与PIN验证码将链接通知审稿人继续进行稿件评审根据审稿意见修订预设、元数据与项目内容。 稿件接收后设置项目发布日期项目内容确认定稿数据集对外公开发布。 平台支持embargo延迟公开提交项目尚未公开时用户可直接修订提交内容无需系统管理员介入。详细总结思维导图代谢组现有数据库痛点3大顶层设计原则核心创新Preset预置元数据模板关键工程技术特性上线后统计至2026‑05与其他主流代谢组库简单对比参考Anal Chem. 2026 Aug 11;98(31):22609-22617. doi: 10.1021/acs.analchem.6c00697.Reviving Data Potential─The Reanalysis-Driven Metabolomics Data Repository MB-POST注AI辅助创作如有不当欢迎指出。内容仅供参考不构成任何建议。

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